Ugrás a tartalomhoz
CertaPeptides
Vissza az összes cikkhez
Research16 perc olvasásApril 10, 2026

HPLC vs tömegspektrometria peptidtisztaság-vizsgálathoz: analitikai módszertani útmutató

Kutatólaboratóriumi összehasonlítás az RP-HPLC, LC-MS és MALDI-TOF módszerekről peptidtisztasági és azonossági vizsgálatokhoz — mikor melyiket érdemes használni, hogyan olvashatók az adatok, és mit jelentenek a számok.

Átnézte: Anca Boboc, CertaPeptides

HPLC vs Mass Spectrometry for Peptide Purity Testing: An Analytical Methods Guide

⚠️ Kizárólag kutatási cél — Ez a cikk technikai referencia képzett laboratóriumi kutatók számára, akik analitikai és kísérleti célokra peptidreagensekkel dolgoznak. Nem orvosi tanács, és a példaként tárgyalt peptideket szigorúan laboratóriumi kutatásra szállítják, nem emberi vagy állatgyógyászati felhasználásra.

Bevezetés

Minden kutatólabor, amely peptideket rendel, előbb-utóbb ugyanazt a kérdést teszi fel: valójában mennyire tiszta ez? A válasz az analitikai tanúsítványon (COA) található, jellemzően két számban és két kromatogramban: egy HPLC tisztasági százalékban és egy tömegspektrumban, amely megerősíti a várt molekulatömeget. Ez a két technika — fordított fázisú HPLC és tömegspektrometria — a modern peptidminőség-ellenőrzés gerince, és együtt két egymást kiegészítő kérdésre adnak választ:

  • A HPLC megmutatja, mennyi a teljes peptidtartalomból a cél szekvencia (tisztaság).
  • A tömegspektrometria megmutatja, mi maga a peptid valójában (azonosság).

Önmagában egyik módszer sem elegendő. Egy peptid lehet HPLC alapján 99% tisztaságú, de rossz szekvenciájú. Lehet tökéletesen helyes tömegspektruma, miközben 20% szennyezőt tartalmaz, amelyek egyetlen HPLC csúcs alatt koeluálnak. A jó peptidkarakterizálás mindkét módszert kombinációban használja, és egyre gyakrabban olyan hibrid technikákat is, mint az LC-MS, amely ugyanazon a műszeren futtatja a HPLC elválasztást és a tömegdetektálást.

Ez a cikk gyakorlati útmutató azoknak a kutatóknak, akik valóban el akarják olvasni és értelmezni a HPLC és MS adatokat — nem csak névértéken elfogadni egy COA-t. A következőket tárgyalja:

  • Hogyan működik az RP-HPLC, és mit jelent valójában a “95% tisztaság”
  • A peptidek három fő tömegspektrometriás formátuma: LC-MS/ESI, MALDI-TOF és hibrid módszerek
  • Hogyan lehet felismerni a gyakori szennyezőket egy kromatogramon vagy spektrumon
  • Mikor melyik technikát érdemes használni
  • Gyakorlati tippek QC adatok futtatásához és értelmezéséhez

1. Miért fontos a peptidtisztaság

Egyszerű biológiai szűréshez a 90% tisztaság elegendő lehet. Szerkezet-aktivitás vizsgálatok, kvantitatív in vitro assay-k, krisztallográfia vagy hosszú időtartamú stabilitásvizsgálatok esetén a szennyezők olyan módon torzíthatják a kísérleti eredményeket, amelyeket utólag szinte lehetetlen hibaelhárítani.

A szintetikus peptidek gyakori szennyezői közé tartoznak:

  • Deléciós szekvenciák: Egy vagy több aminosavmaradék hiányzik a szilárd fázisú szintézis során bekövetkező nem teljes kapcsolás miatt.
  • Csonkolt szekvenciák: Korai lánclezárásból származó rövidült peptidek.
  • Inszerciós szekvenciák: Dupla kapcsolásból származó extra aminosavmaradékok.
  • Nem teljesen deprotektált peptidek: Védőcsoportok (Trt, Pbf, tBu, Boc, Fmoc) maradnak az oldalláncokon vagy az N-terminuson.
  • Oxidált specieszek: +16 Da (Met, Trp, Cys oxidáció) vagy +32 Da (kettős oxidáció).
  • Deamidált specieszek: Asn → Asp vagy Gln → Glu, +1 Da eltolódás.
  • Aszpartimid melléktermékek: Fmoc-SPPS során Asp-Gly, Asp-Ala, Asp-Ser és Asp-Thr szekvenciáknál képződő ciklikus imidek.
  • Racemizált aminosavmaradékok: Kiralitásinverziók, jellemzően Cys, His és Ser esetén hosszan tartó báziskezelés alatt.
  • Gyantával kapcsolatos artefaktumok: A peptidhez még kapcsolódó nyomnyi gyanta-linker fragmentumok.

Ezeknek a szennyezőknek mindegyike jellegzetes mintázattal rendelkezik. A kérdés az, hogy az Ön analitikai módszere látja-e.

Grode et al. (1992, DOI) egy szokatlan szintézis-műterméket írtak le: egy benzil típusú oldallánc-védőcsoportokat (Tos, Bzl és Clz) hordozó peptid HF-es hasítása során ezek a csoportok a peptid N-terminális Fmoc-csoportjára vándoroltak, és négy szennyeződés keletkezett, amelyeket a szerzők gyorsatom-bombázásos tömegspektrometriával és NMR-rel azonosítottak (PMID: 1286938). Ez HF/benzil típusú kémia, nem a modern Fmoc/tBu-szintézisben használt TFA-s hasítás, de jól mutatja, milyen szennyeződés-felderítő munkát tesz lehetővé a tömegspektrometria.

2. Fordított fázisú HPLC: a peptidtisztaság igáslova

Hogyan működik

A fordított fázisú nagy teljesítményű folyadékkromatográfia (RP-HPLC) a peptideket hidrofób állófázissal töltött oszlopon választja el — jellemzően C8 vagy C18 alkil láncokkal funkcionalizált szilikán. Vízből és szerves módosítóból (acetonitril, néha metanol) álló mozgófázis-keverék áramlik át az oszlopon nagy nyomás alatt. Ionpárképző reagenst — szinte mindig trifluorecetsav (TFA) 0.05–0.1% v/v koncentrációban — adnak mindkét fázishoz a peptidionizáció szabályozására és a csúcsalak javítására.

Az elválasztási elv: a peptidek hidrofobitásuk szerint megoszlanak a vizes mozgófázis és a hidrofób állófázis között. A magas vízaránnyal induló, majd magasabb acetonitril-százalék felé emelkedő gradiens a növekvő hidrofobitás sorrendjében eluálja a peptideket. A hidrofóbabb peptidekhez magasabb szerves fázisarány szükséges a C18 állófázisról való deszorpcióhoz.

Egy 210–220 nm-en működő UV detektor (a peptidgerinc amidkötését monitorozva) időben méri az abszorbanciát, és olyan kromatogramot eredményez, amelyben a csúcsok az egyes eluáló specieszeknek felelnek meg.

Mit jelent a “tisztaság HPLC alapján 220 nm-en”

Amikor egy COA azt mondja, hogy “tisztaság ≥98% HPLC alapján 220 nm-en,” ez azt jelenti:

A főcsúcs a teljes integrált csúcsterület legalább 98%-át képviseli 220 nm-en.

Ez területnormalizált százalék — nem abszolút tömegszázalék. Néhány fenntartás:

  • Az abszorbancia az összetételtől függ: 220 nm-en az amidkötés a domináns kromofór, és a válasz nagyjából arányos az amidkötések számával — de az aromás aminosavmaradékok (Trp, Tyr, Phe, His) további abszorbanciát adnak, eltorzítva a relatív választ.
  • A koeluáló szennyezők láthatatlanok: Ha egy deléciós szekvencia vagy diasztereomer a főcsúccsal koeluál, a HPLC területszázalék túlbecsüli a főcsúcsot.
  • A hullámhossz számít: A 220 nm-en mért tisztaság több százalékponttal eltérhet a 280 nm-en mért tisztaságtól (amely az aromás aminosavmaradékokat hangsúlyozza).
  • A nem UV-elnyelő szennyezők láthatatlanok: Sók, TFA, puffer-maradékok és egyes kis szerves molekulák nem nyelnek el 220 nm-en, és egyszerűen nem számítanak bele.

Ezért a COA-n szereplő szám konvenció, nem fizikai állandó. Két különböző labor különböző oszlopokkal és gradiensekkel eltérő tisztasági százalékokat jelenthet ugyanarra a peptidre. A bevált gyakorlat az, hogy tisztasági szám hivatkozásakor mindig meg kell adni az oszlopot, a gradienst, a hullámhosszt és az áramlási sebességet.

Egy tipikus peptid HPLC módszer

  • Oszlop: C18, 4.6 × 150 mm, 3.5 µm vagy 5 µm részecskeméret (analitikai munkához); 250 mm a nagyobb felbontáshoz.
  • Mozgófázis A: 0.1% TFA vízben.
  • Mozgófázis B: 0.1% TFA acetonitrilben.
  • Gradiens: 5% B-ről 65% B-re 20 perc alatt, majd 95% B mosás.
  • Áramlási sebesség: 1 mL/min.
  • Detektálás: 220 nm (elsődleges), 280 nm (aromás keresztellenőrzés).
  • Injektálás: 10–20 µL körülbelül 1 mg/mL peptidoldatból.
  • Oszlophőmérséklet: 25–40 °C, kontrollált.

Shibue et al. (2005, DOI) kimutatták, hogy az ionpárképző reagens típusa és koncentrációja (foszforsav, TFA, PFPA vagy HFBA) jelentősen megváltoztatja a szelektivitást és a felbontást a peptidek RP-HPLC-elválasztásában (PMID: 16013616). Egyetlen általános módszer ezért nem feltétlenül választ el minden közeli rokon specieszt, és minden, ami nem válik el, a főcsúcs részeként integrálódik.

Kromatogram olvasása

Egy tiszta peptidkromatogram egyetlen éles, szimmetrikus főcsúcsot mutat, a következőkkel:

  • Jó csúcsalak: A szimmetriafaktor ideálisan 0.9–1.5.
  • Magas főcsúcsterület: Kutatási minőségű peptideknél jellemzően ≥95%, prémium minőségnél ≥98%.
  • Nincsenek nagy vállak: A vállak részben feloldott szennyezőkre utalnak, gyakran egy aminosavban eltérő deléciós szekvenciákra.
  • Nincsenek későn eluáló csúcsok a mosási fázisba futva: Hidrofób aggregátumokra vagy védőcsoport-adduktokra utalhatnak.
  • Nincsenek korán eluáló csúcsok: Sókra, hidrofil melléktermékekre vagy hasítási termékekre utalhatnak.

3. Tömegspektrometria: az azonosság megerősítése

Az alapmérés

A tömegspektrometria az ionizált molekulák tömeg/töltés arányát (m/z) méri. Peptidek esetében ez a molekulatömeg megerősítését, tömegeltolódott szennyezők (pl. +16 Da oxidáció) detektálását és — MS/MS módban — az aminosav-szekvencia fragmentációs mintázatok alapján történő ellenőrzését jelenti.

Három tömegspektrometriás technika dominálja a peptidelemzést:

  1. Elektroporlasztásos ionizáció (ESI), jellemzően HPLC-hez kapcsolva LC-MS formában
  2. Mátrixszal segített lézeres deszorpció/ionizáció (MALDI), repülésiidő-analizátorhoz kapcsolva MALDI-TOF formában
  3. Nagy felbontású LC-MS (Orbitrap, Q-TOF) pontos tömegmeghatározáshoz

LC-MS elektroporlasztásos ionizációs módszerrel

ESI esetén a HPLC eluens egy keskeny kapillárison keresztül, nagy feszültség alatt porlasztódik. A spray töltött cseppeket hoz létre, amelyek elpárolognak, gázfázisú peptidionokat képezve. Peptideknél az ESI jellemzően többszörösen töltött specieszeket hoz létre — [M+H]⁺, [M+2H]²⁺, [M+3H]³⁺ és így tovább —, a töltésállapot-eloszlás pedig a peptid bázikus aminosavmaradékaitól és az oldat pH-jától függ.

Az LC-MS/ESI előnyei:

  • Online HPLC elválasztás azt jelenti, hogy minden csúcs külön-külön karakterizálható, így a koeluáló specieszek többé nem láthatatlanok.
  • Nagy érzékenység: Nanogramtól pikogramig terjedő mennyiségek rutinszerűen detektálhatók.
  • Natív peptidkörnyezet: A lágy ionizáció megőrzi az intakt molekulaionokat, minimális fragmentációval.
  • Kvantitatív képesség: A kiválasztott ion monitorozása (SIM) és a többszörös reakciómonitorozás (MRM) precíz kvantifikációt tesz lehetővé.

Wu et al. (2020, DOI) folyadékkromatográfiával kapcsolt nagy felbontású tömegspektrometria segítségével mutatták be az arginin-vazopresszin szennyezőinek azonosítását és kvantifikálását, szemléltetve, hogy az LC-MS hogyan képes detektálni és azonosítani szerkezetileg hasonló szintézisszennyezőket, amelyeket a standard HPLC-UV a főcsúcsba olvaszthatna (PMID: 32247289).

Tömegspektrum olvasása

Egy jó LC-MS jelentés egy peptidről tartalmazza:

  • Extrahált ionkromatogram (XIC) a várt [M+H]⁺ vagy [M+nH]ⁿ⁺ m/z értéknél.
  • Tömegspektrum a főcsúcs apexénél, amely mutatja a töltésállapot-burkot.
  • Dekonvolvált semleges tömeg, a töltésállapot-eloszlásból számítva.
  • Elméleti tömeg a cél szekvenciára, összehasonlításként.
  • Tömegpontosság, delta tömegként Da-ban vagy milliomodrész (ppm) egységben jelentve. Nagy felbontású műszereknél a <5 ppm jellemző; kis felbontású műszereknél a <0.5 Da gyakori.

Gyakori tömegeltolódott szennyeződési mintázatok, amelyeket érdemes keresni:

  • +16 Da: Monooxidáció (jellemzően Met, Trp vagy Cys).
  • +32 Da: Dioxidáció.
  • −17 Da: Ammónia-vesztés, jellemző az N-terminális Gln pyroGlu-vá ciklizálódására.
  • −18 Da: Vízvesztés, gyakori Ser, Thr, Asp esetén.
  • +14 Da: Metiláció vagy Val/Leu szubsztitúciós hiba.
  • +1 Da: Asn vagy Gln deamidációja, vagy Asn helyett Asp szubsztitúciós hiba.
  • Deléciós szekvencia tömegeltolódások: −57 (Gly), −71 (Ala), −87 (Ser), −97 (Pro), −99 (Val), −113 (Leu/Ile), −128 (Gln/Lys), −147 (Phe), stb.

MALDI-TOF tömegspektrometria

A mátrixszal segített lézeres deszorpciós/ionizációs repülésiidő-tömegspektrometria (MALDI-TOF) esetén a peptidet UV-elnyelő mátrixszal kokristályosítják (3 kDa alatti peptideknél gyakran α-ciano-4-hidroxifahéjsav, nagyobb peptideknél/proteineknél szinapinsav). Egy pulzáló UV lézer deszorbeálja és ionizálja a peptidet, főként egyszeresen töltött [M+H]⁺ ionokat hozva létre. Az ionokat meghatározott feszültség gyorsítja, majd egy repülési csövön haladnak át; a repülési idő kalibrációval m/z értékké alakul.

A MALDI-TOF előnyei:

  • Egyszerűség és gyorsaság: Percskálájú minta-előkészítés, másodpercek spektrumonként.
  • Egyszeres töltésállapot: Könnyebben értelmezhető spektrumok töltésállapot-dekonvolúció nélkül.
  • Sókkal és pufferekkel szembeni tolerancia: Kevésbé kényes a minta tisztaságára, mint az ESI.
  • Széles tömegtartomány: Kis peptidektől nagy proteinekig lefed egyetlen műszeren.

Schaiberger és Moss (2008, DOI) MALDI-mintaelőkészítési módszert írtak le védett szintetikus peptid-intermedierekhez, amelyet reakciókövetésre, hibaelhárításra és minőségellenőrzésre szántak a peptidek folyamatfejlesztésében (PMID: 18295503).

Hátrányok:

  • Alacsonyabb érzékenység szennyezőkre: A mátrix okozta ionelnyomás elrejtheti a <1% relatív intenzitással jelen lévő kisebb szennyezőket.
  • Nincs beépített elválasztás: Az LC-MS-szel ellentétben nincs kromatográfiás felbontás — az együtt jelen lévő specieszek versengenek az ionizációért.
  • Legfeljebb félkvantitatív: A kristályosodás pontról pontra jelentkező variabilitása miatt a relatív csúcsmagasságok nem megbízható kvantitatív indikátorok.

Ezek miatt a MALDI-TOF-ot jellemzően azonosság-megerősítő eszközként használják olyan mintán, amelynek tisztaságát HPLC-vel már felmérték, nem pedig önálló tisztasági módszerként.

Nagy felbontású MS (Orbitrap, Q-TOF)

A nagy felbontású műszerek <5 ppm tömegpontosságot és >30,000 felbontóképességet biztosítanak, ami lehetővé teszi:

  • Pontos tömegmegerősítés ppm alatti precizitással, kizárva az azonos névleges tömegű szennyezőket.
  • Izotópmintázat-illesztés, amely diagnosztikus az elemi összetételre.
  • MS/MS szekvencia-ellenőrzés CID, HCD vagy ETD fragmentációval.

Kutatási peptideknél, ahol az abszolút azonossági bizonyosság számít — krisztallográfia, kvantitatív in vitro assay-k, SAR vizsgálatok — a nagy felbontású LC-MS az arany standard.

4. HPLC vs. tömegspektrometria: egymás mellett

Paraméter RP-HPLC (UV) LC-MS (ESI) MALDI-TOF
Elsődlegesen megválaszolt kérdés Mennyi a célkomponens? Mi az egyes komponensek azonossága? Azonosság megerősítése
Elválasztás Igen (kromatográfiás) Igen (kromatográfiás) Nem
Azonosság megerősítése Nem — csak retenciós idő Igen — molekulatömeg Igen — molekulatömeg
Érzékenység kisebb szennyezőkre Mérsékelt (csak UV-látható) Magas (tömegszelektív) Alacsonyabb (ionelnyomás)
Kvantitatív? Igen (terület %) Igen (extrahált ion) Félkvantitatív
Tömegpontosság N/A 5–500 ppm jellemző 50–500 ppm jellemző
Futási idő 10–40 min mintánként 10–40 min mintánként 1–5 min mintánként
Minta-előkészítés összetettsége Alacsony Alacsony Alacsony–mérsékelt
Sókkal szembeni tolerancia Mérsékelt Alacsony — illékony puffereket igényel Magas
Tipikus használat peptid QC-ben Elsődleges tisztasági metrika Azonosság + koeluációs elemzés Gyors azonosság-megerősítés

Mikor melyiket használja

  • RP-HPLC 220 nm-en: Mindig. Ez az első vonalbeli tisztaságfelmérés és a COA állítások referencia pontja.
  • LC-MS: Az azonosság megerősítésére és annak ellenőrzésére, hogy semmi nem rejtőzik a fő HPLC csúcs alatt. Elengedhetetlen minden olyan peptidhez, amelyet kvantitatív in vitro assay-kben használnak.
  • MALDI-TOF: Gyors azonosság-megerősítésre, különösen amikor egy tételt gyorsan kell ellenőrizni. Jó kiegészítője a HPLC-nek.
  • Nagy felbontású MS: Amikor abszolút azonosság szükséges — publikációk, formális analitikai jelentések vagy olyan kutatás esetén, ahol a szennyezők pontos azonossága számít.
  • Aminosav-analízis (AAA): Az abszolút kvantitatív peptidtartalom arany standardja — nem tisztasági technika, hanem referencia módszer, amikor a “peptid milligrammokban” pontossága szükséges.
  • NMR: Szerkezeti megerősítésre és olyan sztereokémiai problémák (racemizáció, diasztereomerek) azonosítására, amelyek a tömegspektrometria számára láthatatlanok.

5. Gyakorlati laboratóriumi szempontok

COA olvasása

Amikor analitikai tanúsítványt kap egy kutatási peptidhez, ellenőrizze:

  1. Szekvencia: Megfelel annak, amit rendelt (egybetűs vagy hárombetűs kód)?
  2. Molekulatömeg: Elméleti átlagos tömeg és monoizotópos tömeg. Egyezik az MS jelentés?
  3. HPLC tisztaság és feltételek: Százalék + hullámhossz + oszlop + gradiens. A feltételek nélküli szám értelmetlen.
  4. MS adatok: Műszer, ionizációs mód, megfigyelt vs. elméleti tömeg, tömegpontosság.
  5. Ellenion-tartalom: A legtöbb szintetikus peptid TFA só, hacsak nem alakították át; a tényleges peptidtartalom jellemzően a nettó tömeg 70–90%-a.
  6. Maradék nedvesség: Jellemzően <5%; a <3% jobb.
  7. Elemzés dátuma: A peptidek liofilizált formában is degradálódnak. Egy friss elemzés informatívabb, mint egy két évvel korábbi.

Saját ellenőrzések futtatása

Ha hozzáfér HPLC-hez, mindig futtasson gyors tisztaságellenőrzést minden olyan peptiden, amelyet kvantitatív munkában fognak használni:

  • Hasonlítsa össze a retenciós időt és a csúcsmintázatot korábban kapott tételekkel vagy referenciaanyaggal.
  • Figyelje az új csúcsokat, amelyek korábban nem voltak jelen — ezek tárolással kapcsolatos degradáció indikátorai.
  • Rögzítsen referencia kromatogramot minden tételhez, hogy a későbbi összehasonlítások lehetségesek legyenek.

LC-MS ellenőrzésekhez a várt [M+H]⁺ vagy [M+2H]²⁺ célzott monitorozása általában elegendő az azonosság megerősítéséhez; a teljes pásztázású MS jobb a szennyezők felfedezésére.

TFA ellenionok kezelése

A legtöbb szintetikus peptidet TFA sóként szállítják. A TFA erősen ionpárt képez bázikus aminosavmaradékokkal (Arg, Lys, His), és hozzájárul a nettó tömeghez. Ha az abszolút peptidtartalom számít — ahogy minden kvantitatív assay-ben számít —, Önnek vagy:

  • Aminosav-analízis elvégzése szükséges a valódi peptidtartalom meghatározásához.
  • Peptidtartalmat deklaráló COA használata szükséges.
  • Más sóformára alakítás szükséges (pl. acetát vagy HCl), ami ioncserét vagy megfelelő savból végzett ismételt liofilizálást igényel.

TFA-érzékeny assay-khez (pl. bizonyos sejtalapú assay-k, ahol a nyomnyi TFA interferálhat) az acetátsók előnyösebbek lehetnek.

Gyakori buktatók

  • Túl sok minta injektálása: A túlterhelt oszlopok torz csúcsalakokat és pontatlan területszázalékokat eredményeznek. Az injektált tömeget az oszlophoz kell méretezni.
  • A mosási fázis figyelmen kívül hagyása: Egyes szennyezők csak a magas szerves arányú mosásban eluálnak. Hosszabbítsa meg a gradienst vagy a mosást, hogy befogja őket.
  • Csak az UV területszázalékban bízni: Kombinálja MS-sel, amikor csak lehetséges.
  • Az oszlop monitorozásának elmulasztása: Az oszlopteljesítmény használat közben romlik; rendszeresen futtasson referencia standardot a retenciós idő stabilitásának ellenőrzésére.

6. Gyakran feltett kutatási kérdések

Q1: A peptidem HPLC alapján 98% tisztaságú, de a tömegspektrum egy második csúcsot mutat +16 Da-nál. Mi történik?
Szinte biztosan részleges oxidációról van szó, legvalószínűbben Met, Trp vagy Cys esetén. Az oxidált forma koeluálhat vagy részben koeluálhat a főcsúccsal, így UV-val láthatatlan, MS-sel viszont látható. Elemezze újra hosszabb, laposabb HPLC gradienssel, hogy megpróbálja feloldani az oxidált specieszt, és ellenőrizze a tárolási feltételeket — az oxidáció gyakran levegőexpozíció vagy nyomnyi fémkontamináció jele.

Q2: Miért jelentenek különböző laborok eltérő tisztasági százalékokat ugyanarra a peptidre?
Mert a “HPLC szerinti tisztaság” módszerfüggő szám. Különböző oszlopok, gradiensek, hullámhosszak és integrációs paraméterek eltérő területszázalékokat eredményeznek. Két labor, amely különböző módszereket futtat ugyanazon az anyagon, legitim módon jelenthet 1–3%-kal eltérő százalékokat. A közvetlen összehasonlítás egyetlen módja ugyanazon módszer használata.

Q3: Az LC-MS mindig jobb, mint a HPLC önmagában?
Szennyeződetektálás és azonosság-megerősítés szempontjából igen. Validált módszerrel végzett tiszta kvantitatív tisztaságfelméréshez a HPLC-UV továbbra is a kompendiális standard. Az ideális munkafolyamat: HPLC-UV a százalékhoz, LC-MS az azonossághoz és a koeluációs ellenőrzéshez.

Q4: Mit tegyek, ha a tömegspektrum nem egyezik a várt tömeggel?
Először ellenőrizze a gyakori módosításokat: nem teljesen eltávolított védőcsoportok (+56 tBu, +252 Pbf, +242 Trt, +272 Mmt, +100 Boc, +222 Fmoc), oxidáció (+16, +32), deamidáció (+1), vízvesztés (−18), ammónia-vesztés (−17). Ha nem tudja megmagyarázni a tömegeltolódást, lépjen kapcsolatba a beszállítóval, és kérje a tétel újraelemzését.

Q5: Honnan tudom, hogy az oszlopom még jó?
Rendszeresen futtasson referencia standardot, és monitorozza a csúcsalakot, a retenciós idő stabilitását és a tányérszámot. A retenciós idő >0.5 min driftje, a szimmetriafaktor >2 értéke vagy a látható nyomásemelkedés oszlopdegradációra utal. A legtöbb analitikai C18 oszlop 500–2000 injektálásig ad megbízható eredményeket a minta tisztaságától és a mozgófázis agresszivitásától függően.

Hivatkozások

  1. Grode, S. H., Strother, D. S., Runge, T. A., & Dobrowolski, P. J. (1992). Hydrogen fluoride catalyzed migration of side chain protecting groups onto Fmoc during solid phase peptide synthesis. International Journal of Peptide and Protein Research, 40(6), 538–545. DOI: 10.1111/j.1399-3011.1992.tb00438.x (PMID: 1286938)
  2. Wu, P., Ye, S., Li, M., Li, H., Kan, Y., & Yang, Z. (2020). Impurity identification and quantification for arginine vasopressin by liquid chromatography/high-resolution mass spectrometry. Rapid Communications in Mass Spectrometry, 34(12), e8799. DOI: 10.1002/rcm.8799 (PMID: 32247289)
  3. Shibue, M., Mant, C. T., & Hodges, R. S. (2005). Effect of anionic ion-pairing reagent hydrophobicity on selectivity of peptide separations by reversed-phase liquid chromatography. Journal of Chromatography A, 1080(1), 68–75. DOI: 10.1016/j.chroma.2005.03.035 (PMID: 16013616)
  4. Schaiberger, A. M., & Moss, J. A. (2008). Optimized sample preparation for MALDI mass spectrometry analysis of protected synthetic peptides. Journal of the American Society for Mass Spectrometry, 19(4), 614–619. DOI: 10.1016/j.jasms.2008.01.010 (PMID: 18295503)
  5. Mant, C. T., & Hodges, R. S. (2006). Context-dependent effects on the hydrophilicity/hydrophobicity of side-chains during reversed-phase high-performance liquid chromatography. Journal of Chromatography A, 1125(2), 211–219. DOI: 10.1016/j.chroma.2006.05.063 (PMID: 16814308)
  6. Aebersold, R., & Mann, M. (2003). Mass spectrometry-based proteomics. Nature, 422(6928), 198–207. DOI: 10.1038/nature01511 (PMID: 12634793)
  7. Domon, B., & Aebersold, R. (2006). Mass spectrometry and protein analysis. Science, 312(5771), 212–217. DOI: 10.1126/science.1124619 (PMID: 16614208)
  8. Karas, M., & Hillenkamp, F. (1988). Laser desorption ionization of proteins with molecular masses exceeding 10,000 daltons. Analytical Chemistry, 60(20), 2299–2301. DOI: 10.1021/ac00171a028 (PMID: 3239801)

Az idézetek PubMed adatbázisból származnak. A teljes módszertani részletekért kérjük, tekintse meg az eredeti forrásokat.


Nem emberi fogyasztásra. Kizárólag laboratóriumi kutatási cél.

Jogi nyilatkozat: A CertaPeptides által értékesített minden termék kizárólag laboratóriumi kutatási célra szolgál. Nem emberi vagy állatgyógyászati felhasználásra. Nem fogyasztásra. Ez a cikk az analitikai kémiát kizárólag kutatási kontextusban tárgyalja. A kutatók felelősek minden vonatkozó jogszabály, intézményi szabályzat és etikai irányelv betartásáért, amelyek a kutatási peptidek kezelését szabályozzák.

Ellenőrizze, mielőtt kutat

A termékoldalak osztályszintű specifikációt mutatnak, ha van ilyen nyilvántartva, a kiválasztott tételekhez pedig független, harmadik fél által kiállított COA tartozik.

Kapcsolódó cikkek

Készen áll a kutatás megkezdésére?

A termékoldalak osztályszintű specifikációt mutatnak, ha van ilyen nyilvántartva; a kiválasztott tételekhez független, harmadik fél által kiállított COA tartozik. Adja meg az injekciós üvege címkéjén szereplő kódot az igazolási oldalunkon. Ha a kódra a keresés nem ad találatot, küldje el nekünk e-mailben ezt a kódot.

Ajánljon egy kutatót

Szóljon egy kutatótársának

Adjon 15% kedvezményt, és kapjon 10%-ot vissza az első rendelésük után.